Geri yıkama işlemi, su akışını tersine çevirerek filtreyi temizler. Sistemin geri kalanından gelen temiz su, filtre çıkışına yönlendirilirken, aynı anda giriş vanası kapanır ve tahliye vanası açılır. Yukarı doğru akan su, kum yatağını genişleterek sıkışan parçacıkları serbest bırakır ve bu parçacıklar tahliye hattından dışarı atılır. Bu işlem manuel olarak gerçekleştirilebilir veya otomatik olarak ayarlanabilir. Otomatik bir sistem, geri yıkama döngüsü için sürekli temiz su temini sağlamak amacıyla en az iki filtre gerektirir.